let-7 靶基因 PCR 芯片可用于研究 84 个 hsa-let-7a-5p 靶基因的表达。该芯片包括目前已知的由 hsa-let-7a-5p 调控的靶基因,还包括由其他 miRNAs 调控的靶基因,这些 miRNAs 具有与 hsa-let-7a-5p 相同的种子序列, 包括 hsa-let-7b-5p,hsa-let-7d-5p,hsa-let-7d-5p,hsa-let-7e-5p,hsa-let-7f-5p、hsa-let-7g-5p、hsa- let-7i-5p、hsa-miR-98-5p、hsa-miR-4458 和hsa-miR-4500。miRNA 靶基因表达分析为进一步了解这些特异性miRNA的功能提供了新的视角。利用该芯片研究者即能够利用该芯片简单可靠地同时检测一组可能受 let-7a 调控的基因的表达。
Experimentally Verified let-7a Target Genes:AGO4, BCL2L1(BCLXL), BSG, CASP3, CCNA2, CCND1, CCND2,
CDC25A, CDC34, CDK6, CLOCK, COL1A2, DICER1, E2F1, E2F2, HOXA9, IFNB1, IGF2BP1, IL13, IL6, ITGB3, KLK10, KLK6, KRAS, LIN28 A, MAPK14(p38ALPHA), MYC, MYCN, NCOA3, NF2, NKIRAS2, NR2E1, NRAS, PRDM1, RAVER2, SALL4, SLC11A2, SOCS4, TGFBR1 (ALK5), TLR4, TRIM71, TUSC2, UHRF2, WNT1.
Bioinformatically Predicted let-7a Target Genes: ACVR1B, ADAMTS8, BZW1, CCP110, CEP135, CHD4, COL3A1, COL5A2, DDX19B, DUSP1(PTPN16), ELP1, FRMD4B, GATM, GDF6, GNPTAB, HIF1AN, HIP1, IGF2BP3, IQCB1, LRIG2, LRI G3, MAP4K3, MAPK6(ERK3), MAPK8(JNK1), NPHP3, PARM1, PBX3, PDPR, PLA2G3, PLXNC1, PPP2R2A, RANBP2, RASGRF2, RCN 1, SMC1A, USP12, USP32, WDR37, ZBTB5, ZFYVE26.